運行軟件，單擊界面中的“Keys”圖標進入Key管理界面，單擊“File”下的“New”選項新建一個公開密鑰文件，接著在彈出的“保存文件”對話框中輸入保存文件名和路徑。
單擊Key管理界面的“Create”圖標，然后彈出的界面中輸入你的姓名和E-mail地址（如圖1），Key Expiration Date則是用來設置公開密鑰的使用期限，超過這個日期公開密鑰就宣告失效。點“OK”按鈕后彈出加密密碼口令設置窗口，設置完成后系統將開始建一個新的公開密鑰（如圖2），你只要將此密鑰文件寄給向你發送E-mail的人，對方用Puffer將E-mail內容按你的公開密鑰加密，就可以作為電子郵件的附件寄給你了。
當你收到別人給你發送使用你的公開密鑰加密過的電子郵件，你需要進行解密才能閱讀。進入Puffer軟件主窗口（如圖3），設置好待解密的文件來源和解密后的文件輸出方式，然后單擊“Decrypt”按鈕。此時將出現一個對話框，讓你選擇解密使用的公開密鑰并輸入相對的口令。單擊解密窗口中的“Key Ring”按鈕，在跳出的文件選擇對話框中，選擇保存有你自己的公開密鑰的文件。在“輸入口令”框中輸入創建公開密鑰時設置的口令，最后單擊“Decrypt”按鍵即可將加密的文件解密，我們就可以閱讀加密的郵件了。
