IIS提供Web權限，如讀和寫；NTFS也有它的讀寫權限，兩者容易引起混淆。 IIS權限與NTFS權限的關鍵區別在于：Web權限控制允許對HTTP資源執行的 HTTP命令，NTFS權限控制用戶對硬盤資源的訪問權限。
系統管理員可以在IIS屬性頁的Web主目錄標簽、目錄標簽或虛擬目錄標簽中，通過對“讀取”及“寫入”復選框的選擇，設置上述Web權限；而NTFS權限是通過文件系統來設定的。在通過HTTP協議訪問系統資源時，如果Web權限和NTFS權限設置不一致， HTTP請求將使用兩者中更嚴格的一個。例如，如果NTFS權限是讀，則意味著Web權限也是讀；如果NTFS權限是讀，即使Web權限是讀寫，HTTP的寫請求也會失敗。
