應(yīng)用指紋進(jìn)行身份認(rèn)證已經(jīng)有很長(zhǎng)歷史了。據(jù)考古學(xué)家證實(shí)：公元前7000年到6000年以前，指紋作為身份鑒別的工具已經(jīng)在中國(guó)和古敘利亞開(kāi)始應(yīng)用，一些粘土陶器上留有陶藝匠人的指紋，一些文件上印有起草者的大拇指指紋，在古城市的房屋留有磚匠的指紋等。由此可見(jiàn)，指紋的一些特征在當(dāng)時(shí)已經(jīng)被人們認(rèn)識(shí)和接受。

19世紀(jì)初，科學(xué)研究發(fā)現(xiàn)了至今仍然承認(rèn)的指紋的兩個(gè)重要特征，一是兩個(gè)不同手指的指紋紋脊的式樣不同，另外一個(gè)是指紋紋脊的式樣終生不變。也就是這個(gè)關(guān)于指紋唯一性和不變性的研究成果使得指紋在犯罪事件的鑒別中得以正式應(yīng)用，1896年阿根遷首次應(yīng)用，然后是1901年的蘇格蘭，20世紀(jì)初其他國(guó)家也相繼應(yīng)用到犯罪事情的鑒別中。

不過(guò)，這之前的指紋識(shí)別都采用手工的方法，即將指紋卡片存放在指紋庫(kù)中，需要時(shí)在指紋庫(kù)中人工查找、由指紋專家對(duì)比指紋卡。這種方法一方面效率低下，另一方面投入的人力資源太大。

到了20世紀(jì)60年代，由于計(jì)算機(jī)可以有效地處理圖形，人們開(kāi)始著手研究利用計(jì)算機(jī)來(lái)處理指紋。特別是20世紀(jì)80年代，個(gè)人電腦、光學(xué)掃描這兩項(xiàng)技術(shù)的革新，使得它們作為指紋取像的工具成為現(xiàn)實(shí)，從而使指紋識(shí)別可以在其他領(lǐng)域中得以應(yīng)用。隨即，自動(dòng)指紋識(shí)別系統(tǒng)（Automated Fingerprint Identification System，簡(jiǎn)稱AFIS）在法律實(shí)施方面的研究和應(yīng)用在世界許多國(guó)家展開(kāi)。